Beschränken sich Veränderungen im Verdauungstrakt auf die Schleimhaut, so können sie in den meisten Fällen mittels endoskopischer Mucosaresektion (EMR) oder Polypektomie abgetragen werden. Selbst flache Schleimhautveränderungen von mehreren Zentimeter Größe können aus Dickdarm, Magen, Speiseröhre oder aus Bereichen des Dünndarms entfernt werden. Je nach Lokalisation, Größe, Oberflächenmorphologie und Erreichbarkeit des Befundes kommen unterschiedliche Resektionstechniken zum Einsatz. Es wird stets angestrebt die Veränderung plus eine Sicherheitszone von mind. 2-3 mm abzutragen. Im Anschluss wird das geborgene Material dem Pathologen zur Beurteilung unter dem Mikroskop übersandt.